次世代シーケンス受託解析サービス

その他サービス

シングル核 3'RNA-seq
(Single Nuclei 3'RNA Sequencing)

Overviewサービス概要

『シングル核 3'RNA-seq』では、凍結組織または凍結細胞をお預かりし、適切な裸核条件を当社で検討後、10x Genomics社のプラットフォームを用いてシングル核レベルで遺伝子発現を網羅的に解析します。
バルクでの解析では個々の細胞の転写産物がプールされ構成細胞の平均値が結果となりますが、​シングルセル解析では細胞一つ一つについて解析することができ、バルク解析で見えてこなかった細胞ごと発現プロファイルを得ることができます。

シングル核解析において品質の良いデータを得るためには、サンプルの適切な裸核条件の検討工程が非常に重要となります。コストに見合う試験結果をご提供できるよう、ご依頼前に試験サンプルに関してインタビューを行い、品質の良いデータを得るための裸核の条件検討から実施いたします。

さらに、当社ではカウンセリングに基づいたカスタム性の高いシングルセル解析プロセスの構築、論文作成を視野に入れた図版作成など、柔軟な研究支援を行ない、お客様の研究プロジェクトにおけるシングルセル解析の威力を最大化します。

シングルセルレベルで解析する意義

  • 1.細胞の分類:データをもとにした分類で細胞集団の内訳の把握
  • 2.細胞集団の比較:細胞集団間の差異、機能的特徴の発見
  • 3.新しい細胞集団の発見:細胞亜集団の発見・機能解析によるバイオマーカー・創薬標的の発見
  • 4.細胞決定の道筋をたどる:擬似的な時間軸の発見・細胞運命分岐の発見

参考記事

関連メニュー

Price参考価格

プラン リード長 データ量
リード数
参考価格
(/1サンプル)
参考納期
(サンプル受領日から)
シングル核3’RNA-seq
(裸核条件検討含む)
生データプラン 5000細胞
(目安)
- お問い合わせ お問い合わせ
シングル核3’RNA-seq ベーシック解析プラン
(Cell Ranger)
- - お問い合わせ お問い合わせ
  • ・ お見積もりをご希望の際は下記 「お見積もり・お問い合わせ」 フォームからお問い合わせください。
     ご記入いただいた連絡先に弊社スタッフから別途シングルセル解析のお見積もり用の確認フォームをご案内いたします。
     ご記入いただいた内容を踏まえ、Webミーティング等で詳細を確認の上、正式なお見積もり金額を提示いたします。
  • ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
  • バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。

Planサービスプラン

 

RAW DATA PLAN

RD

生データプラン

取得したraw data(生データ)のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

BS

ベーシック解析プラン

Cell Ranger解析のみを実施するプランです。解析結果としてカウントデータを納品します。Loupe Browserを用いてお手元で様々な結果をご覧いただけます。

STANDARD PLAN

SD

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オプション解析メニュー

ORDER MADE PLAN

OM

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

Example解析例

SCROLL