『ショットガンメタゲノムシーケンス』は、環境や生物サンプルから抽出したDNAを対象に、次世代シーケンス技術を用いて微生物叢を網羅的に解析する手法です。 この手法は、微生物群集全体の構成、機能、系統分類などを明らかにするのに非常に有用です。 ターゲットを16S rRNAなどに限定しないため、バクテリアだけではなく、真核生物、ウイルス、古細菌の解析も可能となります。 また、全ゲノムを解析するため、種レベルでの同定も可能となります。
ショットガンメタゲノムシーケンス
（Shotgun Metagenomic Sequencing）
Overviewサービス概要
Planサービスプラン
RAW DATA PLAN
RD
生データプラン
取得したraw data（生データ）のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。
BASIC PLAN
BS
ベーシック解析プラン
基本的な解析を実施するプランです。各サンプルの菌叢を構成する微生物を分類し、多様性の評価を行います。
さらに菌叢に含まれる遺伝子の構成比率についても解析を行います。
STANDARD PLAN
SD
スタンダード解析プランオススメ人気No.1
ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
ORDER MADE PLAN
OM
オーダーメイド解析プラン
ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。
Order Exampleご依頼例
| ご注文例 | プラン | リード長 | データ量 リード数 |
参考納期 (サンプル受領日から) |
サンプル要件 |
|---|---|---|---|---|---|
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得まで | 生データプラン | 150×2 paired-end （PE150） |
6 Gb 40.0M reads |
4-6週 | |
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得 ＋α多様性解析 |
ベーシック解析プラン | 150×2 paired-end （PE150） |
6 Gb 40.0M reads |
6-8週 | |
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得 ＋α多様性解析 ＋群間比較解析 |
スタンダード解析プラン | 150×2 paired-end （PE150） |
6 Gb 40.0M reads |
6-8週 |
- ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
- ・ 参考納期は弊社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。
Example解析例
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