次世代シーケンス受託解析サービス

その他サービス

ショットガンメタゲノムシーケンス
(Shotgun Metagenomic Sequencing)

Overviewサービス概要

当サービスでは、メタゲノムDNAからショットガンライブラリーを作成し、ショートリードシーケンサーを使用して高精度なシーケンスデータを取得します。
医療分野においては、腸内や口腔内の細菌叢の解析が広く行われております。また、環境由来の細菌叢を調査することで、環境状態の評価指標としても活用されています。
従来の16S rRNAを用いたメタゲノム菌叢解析とは異なり、ショットガンメタゲノムシーケンスでは、細菌の種類や構成比率の解析に加え、その細菌が保有する遺伝子の構成も詳細に確認することが可能です。
また、これまで分離が困難であった難培養性細菌の存在確認や、貴重な遺伝資源の取得にも寄与することが明らかになっています。

参考記事

Price参考価格

プラン リード長 データ量
リード数
参考価格
(/1サンプル)
参考納期
(サンプル受領日から)
サンプル要件
ショットガン
メタゲノムシーケンス
生データプラン 150×2 paired-end
(PE150)
6 Gb
40.0M reads
32,000円+税 4-6週
ショットガン
メタゲノムシーケンス
生データプラン 150×2 paired-end
(PE150)
お客様ご指定 お問い合わせ お問い合わせ
  • ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
  • ・ 参考納期は弊社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。

Planサービスプラン

 

RAW DATA PLAN

RD

生データプラン

取得したraw data(生データ)のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

BS

ベーシック解析プラン

基本的な解析を実施するプランです。各サンプルの菌叢を構成する微生物を分類し、多様性の評価を行います。
さらに菌叢に含まれる遺伝子の構成比率についても解析を行います。

STANDARD PLAN

SD

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オプション解析メニュー

ORDER MADE PLAN

OM

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

Example解析例

SCROLL