『Small RNA-seq』では、次世代シーケンスによる網羅的なsmall RNAの発現解析を実施します。miRNAの発現変動やターゲット遺伝子の予測、またRNA-seqとの統合解析も可能です。
データ解析では、発現変動miRNA解析で、群間において有意に発現変動しているmiRNAを抽出し､変動値とそのp値, q値を算出し、
ヒートマップ、Volcano plot、MA plotを描画することで､発現変動の全体像を様々な角度から俯瞰的に掴むことができます。
また、miRNAのターゲット遺伝子予測解析を行うことで、予測されたターゲット遺伝子およびターゲット予測スコアの結果をご覧いただけます。
さらに、miRNAとRNA-seqと統合解析することで、オミクス間の関係を可視化した各種図版を作成します。
その他公共データと組み合わせた統合解析や指定の図版作成などのオーダーメード解析も承っております。
Small RNA-seq
Overviewサービスの概要
Planサービスプラン
RAW DATA PLAN
RD
生データプラン
取得したraw data（生データ）のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。
BASIC PLAN
BS
ベーシック解析プラン
基本的な解析を実施するプランです。各サンプルのmiRNA発現の定量及び各種描画データをもとに群間比較解析前に発現傾向を把握することができます。
STANDARD PLAN
SD
スタンダード解析プランオススメ人気No.1
ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
*実施のために発現変動miRNA解析が必要となります。
※新規miRNAの探索についてはベーシック解析およびスタンダード解析には
含まれておりません。
ご希望の場合は別途ご相談をお願い申し上げます。
ORDER MADE PLAN
OM
オーダーメイド解析プラン
ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。
Order Exampleご依頼例
| ご注文例 | プラン | データ量 リード数 |
参考納期 (サンプル受領日から) |
サンプル要件 |
|---|---|---|---|---|
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得まで | 生データプラン | 10.0M reads | 5-7週 | |
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得 ＋遺伝子発現の定量 |
ベーシック解析プラン | 10.0M reads | 7-9週 | |
| ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得 ＋遺伝子発現の定量 ＋発現変動miRNA解析 |
スタンダード解析プラン | 10.0M reads | 7-9週 |
- ・ オプションでRNA抽出（別途料金）から承ることもできます。
- ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
- ・ 参考納期は弊社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。
- ・ バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。
Example解析例
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