▼RNA-seq　データ取得仕様（例）｜納期：4週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入可能サンプル：total RNA（2検体から）, 凍結組織/凍結細胞（応相談）
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)
標準取得データ量：4Gb（26M total reads）
標準ライブラリー調製方法：Poly-A選択法，Strand-specific

▼RNA-seq　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンシングにより取得したfastqデータのクオリティチェック，トリミング，マッピング，リードカウント，TPM値の算出，階層的クラスタリング，主成分分析，相関分析，ヒートマップ描画を実施します。

▼RNA-seq　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼グラフ作成ツール「Visualization」をご提供

データ解析（ベーシック解析以上）をご注文のお客様には、
弊社開発のグラフ作成ツール「RIAS(ライアス)　Visualization」を試用いただく為にご提供致します。
＜RIAS Visualizationの概要＞
・各種グラフについて、特定の遺伝子や外れ値を除いたデータ等、お客様のご希望と目的に即したグラフを再作成できます。
・作成したグラフは、論文などに自由に掲載いただけます。

▼シングルセル/核RNA-seq　データ取得仕様（例）｜納期：5週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：凍結細胞（出張実験応相談）
シーケンサー：Illumina HiSeq X Ten / NovaSeq 6000
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)
標準取得データ量：120Gb（800M total reads）

▼シングルセル/核RNA-seq　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

CellRanger解析を実施し、カウントデータをご納品します。10x Genomics社 Loupe Browserを用いてお客様ご自身で様々な結果をご覧いただけます。

▼シングルセル/核RNA-seq　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：4週~

結果解釈に必要となるSeuratを用いた標準解析を実施し、クラスタリング解析の結果を10パターンご納品します（メガクラスター解析）。

▼ChIP-seq　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：ChIP-DNA（2検体から）
利用機器：Illumina NovaSeq 6000 / HiSeq X Ten
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)
標準取得データ量：6Gb（40M total reads）

▼ChIP-seq　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンシングにより取得したfastqデータのクオリティチェック，リードクリーニング，マッピング，ピークコール，相関分析，主成分分析，ヒートマップ描画を実施します。

▼ChIP-seq　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼ATAC-seq　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：凍結細胞（2検体から）
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000 / HiSeq X Ten
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end) 標準取得データ量：8Gb（53M total reads）

▼ATAC-seq　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンシングにより取得したfastqデータのクオリティチェック，トリミング，マッピング，ピークコール，相関分析，主成分分析，ヒートマップ描画を実施します。

▼ATAC-seq　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼Infinium MethylationEPIC　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：DNA（8検体単位）
利用機器：Illumina iScan
利用アレイ：Illumina Infinium MethylationEPIC array

▼Infinium MethylationEPIC　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：4週~

アレイにより取得したデータからβ値の算出、検出p値の算出、正規化、バッチエフェクト補正、QC:MDS分析、QC:density plot解析、QC:階層的クラスタリングまでを実施します。

▼Infinium MethylationEPIC　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：4週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼全ゲノムバイサルファイトシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：DNA（2検体から）, 凍結組織/凍結細胞（応相談）
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000

標準取得リード長：PE150 (150bp paired-end)

▼全ゲノムバイサルファイトシーケンス　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンスにより取得したデータからデータQC，リードクリーニング，マッピング，リードカウント，相関分析，メチル化率の算出，主成分分析，階層的クラスタリング，ヒートマップ描画までを実施します。

▼全ゲノムバイサルファイトシーケンス　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼RRBS　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：DNA（2検体から）, 凍結組織/凍結細胞（応相談）
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000
標準取得リード長：PE150 (150bp paired-end)
標準取得データ量：9Gb（60M total reads）

▼RRBS　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンスにより取得したデータからデータQC，リードクリーニング，マッピング，リードカウント，相関分析，メチル化率の算出，主成分分析，階層的クラスタリング，ヒートマップ描画までを実施します。

▼RRBS　データ解析仕様（スタンダードプラン）｜納期：2週~

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼全ゲノムシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：4週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：DNA （2検体から）, 凍結組織/凍結細胞（応相談）
利用機器：Illumina NovaSeq 6000
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)

▼全ゲノムシーケンス　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

※上記はデータ解析のみの価格です。シーケンス費用は別途発生いたします。
シーケンシングにより取得したfastqデータのクオリティチェック，トリミング，マッピング，重複リード除去，SNP/Indelの検出，クオリティ値での再補正，リードカウント，SNP/Indelのリスト作成，SNP/Indelへのアノテーションまでを実施します。

▼全ゲノムシーケンス　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシック解析の内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼全エクソームシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：4週~

※ご依頼検体数に応じたボリュームディスカウントあり
受入サンプル：DNA（2検体から）, 凍結組織/凍結細胞（応相談）
利用機器：Illumina NovaSeq 6000
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)

▼全エクソームシーケンス　データ解析仕様（ベーシック解析）｜納期：2週~

シーケンシングにより取得したfastqデータのクオリティチェック，トリミング，マッピング，重複リード除去，SNP/Indelの検出，クオリティ値での再補正，リードカウント，SNP/Indelのリスト作成，SNP/Indelへのアノテーションまでを実施いたします。

▼全エクソームシーケンス　データ解析仕様（スタンダード解析）｜納期：2週~

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の群間比較解析や機能解析をオプションでお選びいただき実施します。

▼PacBio DNAシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：8週~

受入サンプル：DNA
シーケンサー：PacBio Sequel II(e)
取得データ量目安：40~100Gb/1 SMRT Cell(CLR), 5~30Gb/1 SMRT Cell(CCS)

▼Nanopore DNAシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

受入サンプル：DNA
シーケンサー：Oxford Nanopore Technologies PrometION
取得データ量目安：30~120Gb/1 Cell

▼調製済みライブラリー相乗りシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：4週~

受入サンプル：調製済みライブラリー
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000 / HiSeq X Ten
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)
※ご依頼トータルデータ量が120Gb未満の場合、プーリング未実施のサンプルのみのお受入れとなります。

▼調製済みライブラリーレーンシーケンス　データ取得仕様（例）｜納期：6週~

受入サンプル：調製済みライブラリー
シーケンサー：Illumina NovaSeq 6000 / HiSeq X Ten
標準取得リード長：PE150 (150bp×2 paired-end)
※レーンシーケンスの場合、原則としてプーリングサンプルのみのお受入れとなります。