原核生物RNA-seq
（rRNA除去法, Strand-specific）

次世代シーケンサーを用いて遺伝子発現の網羅的解析を実施します。
『原核生物RNA-seq（rRNA除去法, Strand-specific）』では、rRNAを除去したtotalRNAを用いてライブラリー調製を行います。

RNA-seqは、特定のRNA配列をキャプチャーするマイクロアレイとは異なり、転写産物を網羅的に検出することができます。転写産物の配列を網羅的に調べることで、未知のmRNAアイソフォームやスプライシングバリアントを含む多くの転写産物の情報を得られます。さらに、RNA-seqで得られたデータと比較可能な公共データも豊富に存在するため、遺伝子転写産物の解析における汎用性の高い方法として知られています。

参考記事

・RNA-seqを用いた遺伝子発現解析: 方法と応用

	プラン	リード長	データ量リード数	参考価格（/1サンプル）	参考納期 (サンプル受領日から)	サンプル要件
原核生物RNA-seq （rRNA除去法, Strand-specific）	生データプラン	150×2 paired-end （PE150）	1 Gb 6.7M reads	38,000円+税	5-7週	要件を見る
原核生物RNA-seq （rRNA除去法, Strand-specific）	ベーシック解析プラン	-	-	お問い合わせ	お問い合わせ	-

生データプラン

取得したraw data（生データ）のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

ベーシック解析プラン

基本的な解析を実施するプランです。各サンプルの遺伝子発現の定量及び各種描画データをもとに群間比較解析前に発現傾向を把握することができます。

STANDARD PLAN

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

その他、下記のような3群間以上での比較解析も対応可能でございます。
お気軽にお問合せください。
・k-meansクラスタリング解析

・ベイズ推定を用いた多群比較解析

・時系列変動遺伝子解析

・DEGの共通項評価（ベン図作成含む）

*実施のために発現変動遺伝子(DEG)解析が必要となります。

ORDER MADE PLAN

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

RIAS® Visualization は、次世代シーケンスデータをはじめとする網羅生命科学データを自在にグラフ化し、その生物学的意義の理解を円滑にすることを目的としています。各種グラフについて、特定の遺伝子や外れ値を除いたデータ等、お客様のご希望と目的に即したグラフを再作成できます。

ベーシック解析プラン以上をご依頼の場合、グラフ作成ツール「RIAS(ライアス) Visualization」を120日間ご利用いただけます。
本ツールは、以下のように活用いただけます。

発現量の閾値を変えて、グラフを再作成する

外れ値となるサンプルや不要な遺伝子を除いて、グラフを再作成する

特定の遺伝子に注目してグラフを作成し、発現変動の有意性を評価する

特定の生物学的機能に関わる遺伝子のみのヒートマップを作成する