原核生物RNA-seq
（rRNA除去法, Strand-specific）

RNA-seqは、次世代シーケンシング（NGS）技術を用いて、細胞や組織内のRNA分子を網羅的に解析する手法です。この技術は、遺伝子発現や転写産物の構造を詳細に調べるために利用されます。『原核生物RNA-seq（rRNA除去法, Strand-specific）』では、rRNA除去法でmRNAの精製を実施して次世代シーケンスによる網羅的遺伝子発現解析を実施します。原核生物はmRNAにPolyAを持たず、PolyA選択法ではmRNAの精製ができないため、rRNA除去法を採用しています。弊社が利用しているrRNA除去法はほぼ全てのバクテリアに対応しています。

RNA-seqでは、特定の遺伝子発現の定量化、遺伝子発現量の比較（DEG）、Gene Ontology (GO) 解析、KEGGによるパスウェイ解析、 de noveアセンブル、融合遺伝子解析などが可能となります。その他公共データと組み合わせた統合解析や指定の図版作成などのオーダーメード解析も承っております。

トランスクリプトーム解析のアプリケーション選択でお悩みの方はコチラ

・トランスクリプトーム解析アプリケーション選択ガイド

参考記事

・RNA-seqを用いた遺伝子発現解析: 方法と応用

生データプラン

取得したraw data（生データ）のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

ベーシック解析プラン

基本的な解析を実施するプランです。各サンプルの遺伝子発現の定量及び各種描画データをもとに群間比較解析前に発現傾向を把握することができます。

STANDARD PLAN

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

その他、下記のような3群間以上での比較解析も対応可能でございます。
お気軽にお問合せください。
・k-meansクラスタリング解析

・ベイズ推定を用いた多群比較解析

・時系列変動遺伝子解析

・DEGの共通項評価（ベン図作成含む）

*実施のために発現変動遺伝子(DEG)解析が必要となります。

※IPAパスウェイ解析は2025年3月31日をもってサービスを終了させていただきます。

ORDER MADE PLAN

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

ご注文例	プラン	リード長	データ量リード数	参考納期 (サンプル受領日から)	サンプル要件
ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得まで	生データプラン	150×2 paired-end （PE150）	1 Gb 6.7M reads	5-7週	要件を見る
ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得　＋遺伝子発現の定量	ベーシック解析プラン	150×2 paired-end （PE150）	1 Gb 6.7M reads	7-9週	要件を見る
ライブラリー調製およびシーケンスデータ取得　＋遺伝子発現の定量　＋発現変動遺伝子解析	スタンダード解析プラン	150×2 paired-end （PE150）	1 Gb 6.7M reads	7-9週	要件を見る

・データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
・参考納期は弊社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。
・バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。

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お見積もり・お問い合わせ

RIAS® Visualization は、次世代シーケンスデータをはじめとする網羅生命科学データを自在にグラフ化し、その生物学的意義の理解を円滑にすることを目的としています。各種グラフについて、特定の遺伝子や外れ値を除いたデータ等、お客様のご希望と目的に即したグラフを再作成できます。

ベーシック解析プラン以上をご依頼の場合、グラフ作成ツール「RIAS(ライアス) Visualization」を120日間ご利用いただけます。
本ツールは、以下のように活用いただけます。

発現量の閾値を変えて、グラフを再作成する

外れ値となるサンプルや不要な遺伝子を除いて、グラフを再作成する

特定の遺伝子に注目してグラフを作成し、発現変動の有意性を評価する

特定の生物学的機能に関わる遺伝子のみのヒートマップを作成する