『ChIP-seq（Chromatin Immuno Precipitation Sequencing）』は、転写因子やヒストンとDNAの複合体を抗体で免疫沈降し、濃縮精製されたDNA断片をシーケンスすることで、転写因子と相互作用していたDNA領域や、特定のヒストン修飾が濃縮されたDNA領域を明らかにする手法です。
特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効な手法となります。
特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効
注目したい細胞変化に関わる転写因子やヒストン修飾の探索に有効
| プラン | リード長 | データ量 リード数 |
参考価格 （/1サンプル） |
参考納期 (サンプル受領日から) |
サンプル要件 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ChIP-seq (ChIPed-DNAから) |
生データプラン | 150×2 paired-end （PE150） |
6 Gb 40.0M reads |
36,000円+税 | 5-7週 | |
| ChIP-seq | ベーシック解析プラン | - | - | お問い合わせ | お問い合わせ | - |
RAW DATA PLAN
取得したraw data（生データ）のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。
BASIC PLAN
基本的な解析を実施するプランです。マッピング、ピークコール後、各種描画データを作成の上、群間比較解析前にシグナル傾向を把握することができます。（※InputコントロールやIgGコントロールの有無に関わらずご依頼可能です。）
STANDARD PLAN
ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
*実施のために変動ピーク領域の検出が必要となります。
ORDER MADE PLAN
ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。
RIAS® Peak Explorerは、ピーク比較解析ツールです。
対象となるエピゲノム制御領域の生物学的な意義・役割を予測していく際、複雑なコーディングやツールの使い分けをすることなく、
簡易的・直感的に、複数のATAC-seqデータ・ChIP-seqデータ・ゲノムの比較解析ができます。
ChIP-seqのご依頼の場合、当社開発のピーク比較解析ツール「RIAS(ライアス) Peak Explorer」を120日間ご利用頂けます。
本ツールは、以下のように活用いただけます。
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