次世代シーケンス受託解析サービス

シングルセル 3'RNA-seq
(Single Cell 3'RNA Sequencing)

Overviewサービス概要

『シングルセル 3'RNA-seq』では、10x Genomics社のプラットフォームを用いてシングルセルレベルで遺伝子発現を網羅的に解析します。

バルクでの解析では個々の細胞の転写産物がプールされ構成細胞の平均値が結果となりますが、​シングルセル解析では細胞一つ一つについて解析することができ、バルク解析で見えてこなかった細胞ごと発現プロファイルを得ることができます。

シングルセル解析において品質の良いデータを得るためには、細胞調製の工程が非常に重要となります。コストに見合う試験結果をご提供できるよう、必要に応じてご依頼前に試験サンプルに関してインタビューを行い、品質の良いデータを得るための条件検討サポートを標準サービスとして実施しています。

条件検討サポート前の細胞写真

当社サポート後の細胞写真

さらに、シングルセル解析では細胞一つ一つに対しシーケンスデータが得られるため、バルク解析に比べデータ構造は巨大かつ複雑になります。そのため、データ処理、解析には多大な解析リソースが必要となります。

当社では、細胞調製における条件検討のサポートや、カウンセリングに基づいたカスタム性の高いシングルセル解析プロセスの構築、論文作成を視野に入れた図版作成など、柔軟な研究支援を行い、お客様の研究プロジェクトにおけるシングルセル解析の威力を最大化します。

シングルセルレベルで解析する意義

  • 1.細胞の分類:データをもとにした分類で細胞集団の内訳の把握
  • 2.細胞集団の比較:細胞集団間の差異、機能的特徴の発見
  • 3.新しい細胞集団の発見:細胞亜集団の発見・機能解析によるバイオマーカー・創薬標的の発見
  • 4.細胞決定の道筋をたどる:擬似的な時間軸の発見・細胞運命分岐の発見

参考記事

関連メニュー

Price参考価格

プラン 標準解析細胞数 リード長 データ量
リード数
参考価格
(/1サンプル)
参考納期
(サンプル受領日から)
シングルセル3’RNA-seq
(出張実験応相談)
生データプラン 5000細胞
(目安)
- - お問い合わせ お問い合わせ
シングルセル3’RNA-seq
ベーシック解析プラン
(Cell Ranger)
- - - お問い合わせ お問い合わせ
  • ・ 正式なお見積りにあたりましては、弊社スタッフからご案内する事前確認フォームに記入いただきます。
        その内容を踏まえ、Webミーティング等でサンプルの状態を確認させていただきます。
  • ・ 解析細胞数についてはあくまで目安となり、保証不可となります。
  • ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
  • バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。

Planサービスプラン

 

RAW DATA PLAN

RD

生データプラン

取得したraw data(生データ)のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

BS

ベーシック解析プラン

Cell Ranger解析のみを実施するプランです。解析結果としてカウントデータを納品します。Loupe Browserを用いてお手元で様々な結果をご覧いただけます。

STANDARD PLAN

SD

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オプション解析メニュー

ORDER MADE PLAN

OM

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

Pointシングル解析のポイント

  • 1.細胞の分類 ーデータをもとにした分類で細胞集団の内訳の把握
  • 2.遺伝子発現の違いを通じた細胞集団の比較 ー細胞集団間の差異、機能的特徴の発見
  • 3.新しい細胞集団の発見 ー細胞亜集団の発見・機能解析によるバイオマーカー・創薬標的の発見
  • 4.細胞決定の道筋をたどる ー遺伝子発現変化による疑似的な時間軸の発見・細胞運命分岐の発見

Example解析例

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