次世代シーケンス受託解析サービス

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ヒトDNAメチル化アレイ解析
(Infinium MethylationEPIC v2.0)

Campaignキャンペーン

毎年ご好評いただいております、『冬のシーケンスキャンペーン』が今年も開催中です。
お得な価格でご提供しておりますので、是非この機会にご利用下さい。
※本キャンペーン価格は、データ取得まで(Raw Data納品)の価格となります。
 核酸抽出やバイオインフォマティクス解析も承りますので、お気軽ご相談下さい。

キャンペーン内容は下記のバナーよりご確認下さい。

Overviewサービス概要

『ヒトDNAメチル化アレイ解析 (Infinium MethylationEPIC v2.0)』では、イルミナ社の提供するInfinium MethylationEPICアレイを用いてDNAメチル化解析を行います。
アレイをベースにした解析でありながら、重要なメチル化領域をほぼ全てカバーしているのが特徴です。解析は1塩基レベルではなくプローブや領域レベルとなりますが、エピジェネティックな意義を評価する目的には十分であるため、トップジャーナル掲載の論文を含む多くの研究で採用されています。

DNAメチル化解析の意義

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

Infinium Methylation EPIC v2.0の利用用途 (MSAとの比較)

EPIC v2.0

全メチロームを包括的にカバーし、特にがんや希少疾患研究で詳細かつ広範囲なメチル化解析をおこなうのに有効です。

  • 全メチロームをカバー (RefSeq遺伝子の99%超) して、包括的に解析したい。
  • がん研究や希少疾患研究で、詳細なメチル化プロファイリングを行いたい。
  • MGMT遺伝子を包括的にカバーし、公開されている分類子との互換性を確保したい。
  • 既知のメチル化部位だけでなく、新しいメチル化マーカーを発見したい。

MSA

エピゲノムワイド関連解析(EWAS)を含む一般的な疾患の関連性を大規模にスクリーニングするのに有効です。

  • 大規模な集団コホートのメチル化解析を実施したい。
  • エピゲノムワイド関連解析(EWAS)を実施し、一般的な疾患や環境暴露との関連性を探索したい。
  • 既知の一般的な疾患特性、環境暴露、細胞特異的なメチル化の関連性を解析したい。
  • 高MAF SNPを測定するマルチオミクス機能を利用したい。

参考記事

関連メニュー

Planサービスプラン

 

RAW DATA PLAN

RD

生データプラン

取得したraw data(生データ)のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

BS

ベーシック解析プラン

基本的な解析を実施するプランです。ベーシック解析では各サンプルのメチル化率の算出及び各種描画データを作成の上、群間比較解析前にDNAメチル化傾向を把握することが可能です。

STANDARD PLAN

SD

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オプション解析メニュー

*DMP=Differentially methylated probe(変動メチル化プローブ)

**DMR=Differentially methylated region(変動メチル化領域)

***実施のためにDMP・DMRの検出が必要となります。

ORDER MADE PLAN

OM

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

Order Exampleご依頼例

ご注文例 プラン 参考納期
(サンプル受領日から)
ご依頼単位 サンプル要件
データ取得まで 生データプラン 5-7週 8検体単位
データ取得
 +メチル化率の算出
ベーシックプラン 7-9週 8検体単位
データ取得
 +メチル化率の算出
 +DMP・DMRの検出
スタンダードプラン 7-9週 8検体単位

Example解析例

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