RRBS
（Reduced representation of bisulfite sequencing）

制限酵素Msplを用いて断片化されたゲノムDNAをバイサルファイト処理後、CpGリッチ領域を濃縮し、関連するCpGアイランドに焦点を当てデータ取得することで、少ないデータ量で効率よく個々のシトシン塩基のメチル化状態を解析します。

・DNAメチル化の網羅的解析に
・RNA-seqとの統合解析に

WGBSとの違い

DNAメチル化解析の意義

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。

また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

生データプラン価格（データ取得のみ）

※上記はDNA受入時の価格です。納期は当社サンプル着日からご納品までの期間を示します。

データ解析プラン価格（データ解析のみ）

• ベーシック解析

  価格お問合せ

  基本的な解析を実施するプランです。ベーシック解析では各サンプルのDNAメチル化率の算出及び各種描画データを作成の上、群間比較解析前にDNAメチル化傾向を把握することが可能です。

  1．データQC
  2．トリミング
  3．マッピング
  4．メチル化率の算出
  5．リードカウント
  6.ゲノム領域／CpG領域に基づくメチル化サイトへのアノテーション
  7．図版作成（相関分析、主成分分析、階層的クラスタリング）

• スタンダード解析

  価格お問合せ

  ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

  オプション解析メニュー
  ・2群比較解析（DMC*・DMR**の計算および近傍遺伝子リストの抽出）
  ・DMC*・DMR**近傍遺伝子のGO解析
  ・IPAパスウェイ解析

  *DMC＝Differentially methylated cytosine（可変メチル化シトシン）
  **DMR＝Differentially methylated region（可変メチル化領域）

  その他、RNA-seqデータとの統合解析なども対応できますので、お問い合わせください。

• オーダーメイド解析

  価格お問合せ

  ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが原則必要です。

  ・参考文献を基にした解析
  ・標準サービスメニューに複数回の閾値変更を加えた解析
  ・他アプリケーションデータとの統合解析
  ・公共データとの統合解析
  ・論文用図版作成など

※スタンダード解析における基本比較解析項目（DEG, GO, パスウェイ解析）につきましては、1検体当たりの料金ではなく、2群1比較=1パターンとして、1パターン当たりでの料金設定となります。

※多群比較の場合、1パターンあたりの比較解析料金がディスカウントされますので、お問い合わせ備考欄に実験群（N=●，●群，計●●検体）と比較パターン数（●パターン）をご教示ください。

※プレミアム解析プラン：上記プランのほかに、お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うプランもございます。

データ解析例

CorrelationMatrix

Pca主成分分析

Heatmap

Sedentary_Post_S3_Methylation_Histogram

ゲノム化区分に基づくパイチャート

メチル化区分に基づくパイチャート

メチル化区分およびゲノム区分を合わせたパイチャート

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よくある質問