RRBS
（Reduced representation of bisulfite sequencing）

制限酵素Msplを用いて断片化されたゲノムDNAをバイサルファイト処理後、CpGリッチ領域を濃縮し、関連するCpGアイランドに焦点を当てデータ取得することで、少ないデータ量で効率よく個々のシトシン塩基のメチル化状態を解析します。

　
・DNAメチル化の網羅的解析に
・RNA-seqとの統合解析に

WGBSとの違い

DNAメチル化解析の意義

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。

　
また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

データ解析例

CorrelationMatrix

Pca主成分分析

Heatmap

Sedentary_Post_S3_Methylation_Histogram

　　　　　

ゲノム化区分に基づくパイチャート

　　　　　

メチル化区分に基づくパイチャート

　　　　　

メチル化区分およびゲノム区分を合わせたパイチャート

生データプラン価格（データ取得のみ｜２検体から）

※サンプル受入要件につきましては、下記「ご依頼フォーム」よりご確認ください。

データ解析プラン価格（データ解析のみ）

• 高次解析
  ベーシックプラン

  90,000円

  /1検体

  お客様ご自身でサンプル群間の比較解析を進められることを前提に、シークエンスデータに基本解析を実施するプランです。種々の描画を実施しますので個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
  　
  1．データQC
  　－クオリティスコア
  　－重複リードの頻度
  　－重複リードの分布
  2．リードクリーニング
  3．マッピング
  4．リードカウント
  5．相関分析
  6．メチル化率の算出
  7．主成分分析
  8．階層的クラスタリング
  9．ヒートマップ描画

  ※上記はデータ解析のみの価格であり、シークエンス費用は含まれておりません。

• 高次解析
  スタンダードプラン

  お問い合わせ

  　
  ベーシックプランの解析内容に加え、サンプル群間の比較解析を実施するプランです。比較解析対象とするサンプル群を確認するために、ヒアリングシートをご記入いただいた上でデータ解析を実施します。
  　
  1．データQC
  　－クオリティスコア
  　－重複リードの頻度
  　－重複リードの分布
  2．リードクリーニング
  3．マッピング
  4．リードカウント
  5．相関分析
  6．メチル化率の算出
  7．主成分分析
  8．階層的クラスタリング
  9．ヒートマップ描画
  10．群間比較解析
  　－可変メチル化シトシン(DMC)の計算
  　－可変メチル化領域(DMR)の計算
  　－DMC,DMR近傍遺伝子リストの抽出
  　－近傍遺伝子のGO解析
  　－IPAパスウェイ解析

• 高次解析
  プレミアムプラン

  お問い合わせ

  　
  お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。

  研究目的やご要望に応じたカスタム性の高い高次解析、公共データとの統合解析、論文作成を視野に入れた図版作成など、必要なご支援をオーダーメイドで実施します。

  ・公共データと統合解析
  ・閾値・パラメータ調整
  ・納品後ディスカッション
  ・解析結果解釈サポート
  ・Materials&Methods作成
  ・論文用図版作成など
  　
  ※共同研究の検討も可能ですので、ご遠慮なくお問い合わせください。
  　

※高次解析スタンダードプランにおける群間比較解析項目につきましては、1検体当たりの料金ではなく、2群1比較=1パターンとして、1パターン当たり、または1プロジェクトあたりでの料金設定となります。
　

※多群比較の場合、1パターンあたりの比較解析料金がディスカウントされますので、お問い合わせ備考欄に実験群（N=●，●群，計●●検体）と比較パターン数（●パターン）をご教示ください。

価格シミュレーション

技術資料

編集中

ご依頼フォーム

よくある質問