DNAメチル化アレイ解析
（Infinium® MethylationEPIC）

ヒト検体におけるDNAメチル化解析には、イルミナ社の提供するInfinium® MethylationEPICアレイがコストパフォーマンスに優れます。アレイをベースにした解析でありながら、重要なメチル化領域をほぼ全てカバーしているのが特徴です。解析は1塩基レベルではなく領域レベルとなりますが、エピジェネティックな意義を評価する目的には十分であるため、トップジャーナル掲載の論文を含む多くの研究で採用されています。

　
・85万箇所のメチル化サイトの包括的な解析に
・RNA-seqとの統合解析に

DNAメチル化解析の意義

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。

　
また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

データ解析例

ゲノムおよびCpG区分別のメチル化サイト

ヒートマップ

Density plot

階層的クラスタリング

生データプラン価格（データ取得のみ｜４検体から）

※納期はサンプル受領日からの起算です。

データ解析プラン価格（データ解析のみ）

• 高次解析
  ベーシックプラン

  お問い合わせ

  お客様ご自身でサンプル群間の比較解析を進められることを前提に、シークエンスデータに基本解析を実施するプランです。種々の描画を実施しますので個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
  　
  1．β値の算出
  2．検出p値の算出
  3．正規化
  4．バッチエフェクト補正
  5．QC:MDS分析
  6．QC:density plot解析
  7．QC:階層的クラスタリング

  ※上記はデータ解析のみの価格であり、シークエンス費用は含まれておりません。
  　
  　
  　

• 高次解析
  スタンダードプラン

  お問い合わせ

  　
  ベーシックプランの解析内容に加え、サンプル群間の比較解析を実施するプランです。比較解析対象とするサンプル群を確認するために、ヒアリングシートをご記入いただいた上でデータ解析を実施します。
  　
  1．β値の算出
  2．検出p値の算出
  3．正規化
  4．バッチエフェクト補正
  5．QC:MDS分析
  6．QC:density plot解析
  7．QC:階層的クラスタリング
  8．群間比較解析
  　－DNAメチル化可変プローブ(DMP)の計算
  　－DNAメチル化可変領域(DMR)の計算
  　－DMP,DMR近傍遺伝子リストの抽出
  　－近傍遺伝子のGO解析
  　－IPAパスウェイ解析
  　

• 高次解析
  プレミアムプラン

  お問い合わせ

  　
  お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。

  研究目的やご要望に応じたカスタム性の高い高次解析、公共データとの統合解析、論文作成を視野に入れた図版作成など、必要なご支援をオーダーメイドで実施します。

  ・公共データと統合解析
  ・閾値・パラメータ調整
  ・納品後ディスカッション
  ・解析結果解釈サポート
  ・Materials&Methods作成
  ・論文用図版作成など
  　
  ※共同研究の検討も可能ですので、ご遠慮なくお問い合わせください。
  　

※高次解析スタンダードプランにおける群間比較解析項目につきましては、1検体当たりの料金ではなく、2群1比較=1パターンとして、1パターン当たり、または1プロジェクトあたりでの料金設定となります。
　

※多群比較の場合、1パターンあたりの比較解析料金がディスカウントされますので、お問い合わせ備考欄に実験群（N=●，●群，計●●検体）と比較パターン数（●パターン）を記載してください。

サンプルの受入要件

よくある質問