DNAメチル化アレイ解析
（Infinium® MethylationEPIC）

ヒト検体におけるDNAメチル化解析には、イルミナ社の提供するInfinium® MethylationEPICアレイがコストパフォーマンスに優れます。アレイをベースにした解析でありながら、重要なメチル化領域をほぼ全てカバーしているのが特徴です。解析は1塩基レベルではなく領域レベルとなりますが、エピジェネティックな意義を評価する目的には十分であるため、トップジャーナル掲載の論文を含む多くの研究で採用されています。

　
・85万箇所のメチル化サイトの包括的な解析に
・RNA-seqとの統合解析に

DNAメチル化解析の意義

DNAのメチル化は対象配列のDNA結合因子との親和性を変化させるため、DNAの配列変異と同様に、遺伝子活性の変化を引き起こし得ます。このことから、通常の配列解析では見えない遺伝子活動の変化を明らかにする目的で実施されます。

　
また、DNAのメチル化が様々な疾患や健康状態に相関するエピジェネティック・バイオマーカーとして機能することが報告されています。

データ解析例

ゲノムおよびCpG区分別のメチル化サイト

ヒートマップ

Density plot

階層的クラスタリング

生データプラン価格（データ取得のみ｜8検体単位）

※上記はDNA受入時の価格です。納期はサンプル受領日からの起算です。

データ解析プラン価格（データ解析のみ）

• ベーシック解析

  価格：お問合せ

  基本解析を実施するプランです。種々の描画により、個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
  　
  1．β値の算出
  2．検出p値の算出
  3．正規化
  4．バッチエフェクト補正
  5．QC:MDS分析
  6．QC:density plot解析
  7．QC:階層的クラスタリング

• スタンダード解析

  価格：お問合せ

  ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。
  　
  ベーシック解析＋オプション解析
  ・群間比較解析
  －DMP(可変メチル化プローブ)・DMR(可変メチル化領域)の計算および近傍遺伝子リストの抽出
  －DMP・DMR近傍遺伝子のGO解析
  －IPAパスウェイ解析
  　
  その他、RNA-seqデータとの統合解析なども対応できますので、お問い合わせください。

• プレミアム解析

  価格：お問合せ

  お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。

  研究目的やご要望に応じたカスタム性の高い高次解析、公共データとの統合解析、論文作成を視野に入れた図版作成など、必要なご支援をオーダーメイドで実施します。

  ・公共データと統合解析
  ・閾値・パラメータ調整
  ・納品後ディスカッション
  ・解析結果解釈サポート
  ・Materials&Methods作成
  ・論文用図版作成など

※スタンダード解析における群間比較解析項目につきましては、1検体当たりの料金ではなく、2群1比較=1パターンとして、1パターン当たり、または1プロジェクトあたりでの料金設定となります。
　

※多群比較の場合、1パターンあたりの比較解析料金がディスカウントされますので、お問い合わせ備考欄に実験群（N=●，●群，計●●検体）と比較パターン数（●パターン）を記載してください。

サンプルの受入要件

よくある質問