全エクソームシーケンス
(Whole Exome sequeincing:WES)
illumina NovaSeq6000を用いて、対象サンプルのタンパク質をコードするエクソン領域を選択的に取得し、低価格かつ効率的に解析します。ヒト・マウスに適用可能です。
生データプラン価格(データ取得のみ)
10検体以上でさらにディスカウント!
データ量 | UTR | 取得リード長 | 価格/1検体(税抜) | |
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ヒトWES | 6Gb | なし | PE150 | ¥40,000 |
ヒトWES | 12Gb | なし | PE150 | ¥47,000 |
マウスWES | 6Gb | なし | PE150 | ¥77,000 |
マウスWES | 12Gb | なし | PE150 | ¥85,000 |
※上記は精製ゲノムDNAをお送り頂く場合の価格となります。抽出から請け負うことも可能です。
データ解析例
データ解析プラン価格(データ解析のみ)
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高次解析
ベーシックプラン35,000円
/1検体お客様ご自身でサンプル群間の比較解析を進められることを前提に、シークエンスデータに基本解析を実施するプランです。種々の描画を実施しますので個別サンプル間のばらつきをスピーディに俯瞰頂けます。
1.データQC
2.リードクリーニング
3.マッピング
4.重複リードの除去
5.リアライメント
6.SNP/Indelの検出
7.SNP/Indelリストの作成
8.SNP/Indelへのアノテーション[dbSNP/SNPeFF]※上記はデータ解析のみの価格であり、シークエンス費用は含まれておりません。
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高次解析
スタンダードプランお問い合わせ
ベーシックプランの解析内容に加え、サンプル群間の比較解析を実施するプランです。比較解析対象とするサンプル群を確認するために、ヒアリングシートをご記入いただいた上でデータ解析を実施します。
1.データQC
2.リードクリーニング
3.マッピング
4.重複リードの除去
5.リアライメント
6.SNP/Indelの検出
7.SNP/Indelリストの作成
8.SNP/Indelへのアノテーション[dbSNP/SNPeFF]
9.SNP/Indelへのアノテーション[CCDS/1000人ゲノムプロジェクト]
10.Rhelixa Variant Viewerの提供(変異部位の視覚化)
11. GWAS(Genome Wide Association Study)解析
12.群特異的SNP/Indelリストの作成 -
高次解析
プレミアムプランお問い合わせ
お客様の研究分野に関する情報を頂き、論文化や事業化までの研究サポートを行うコンサルティングサービスです。
研究目的やご要望に応じたカスタム性の高い高次解析、公共データとの統合解析、論文作成を視野に入れた図版作成など、必要なご支援をオーダーメイドで実施します。
・公共データと統合解析
・閾値・パラメータ調整
・納品後ディスカッション
・解析結果解釈サポート
・Materials&Methods作成
・論文用図版作成など※共同研究の検討も可能ですので、ご遠慮なくお問い合わせください。
※高次解析スタンダードプランにおける群特異的SNP/Indelリストの作成につきましては、1検体当たりの料金ではなく、2群1比較=1パターンとして、1パターン当たりでの料金設定となります。
※多群比較の場合、1パターンあたりの比較解析料金がディスカウントされますので、お問い合わせ備考欄に実験群(N=●,●群,計●●検体)と比較パターン数(●パターン)をご教示ください。
価格シミュレーション
サンプル受入要件
よくある質問
DNA抽出はヒト・マウス由来細胞・組織のみで、最低4検体以上から承っております。DNA抽出料金は、生データプランのみのご依頼の場合、抽出料金は10,000円+税/1検体です。データ取得+データ解析プランセットでのご依頼の場合、5,000円+税/1検体でお受けしております。
SNPおよびIndelに対して、トランスクリプトに対する塩基・アミノ酸置換部位・タンパク質への影響・疾患情報(Clinvar)におけるアリル頻度情報を付与します。
また、高次解析スタンダードプランをご依頼のお客様へは、変異部位を視覚的に確認できるアプリケーション(Rhelixa Variant Viewer)を提供します
ゲノムワイドに検出したSNPを用いて、特定の形質に作用する可能性のあるゲノム領域を探索します。
2群以上において各群で共通する、または群特異的なSNP/Indelを探索し、リストを作成します。