核酸抽出からご依頼頂く場合は、最低4検体以上からとなります。料金につきましてはお問い合わせください。

目的によって異なりますが、一般的にヒトやマウスでは1検体あたり2000万から4000万リードが必要と言われています。

poly-A選択法では、totalRNAからmRNAを抽出し、シーケンスを実施することになりますので、翻訳される遺伝子の発現量を網羅的に取得します。rRNA除去法では、rRNAのみを取り除くことになりますので、mRNAのみならず、rRNA以外のnon-coding RNAの発現量についても取得することができます。

ベーシックプランはお客様ご自身でサンプル群間の比較解析を進められることを前提とした、基本解析のみを実施するプランです。本プランでは、サンプル個別の遺伝子発現量を算出した上で、データのばらつきを図示します。他社サービスとの違いとして、相関分析、クラスタリング、PCA解析、ヒートマップ作図まで実施いたしますので、個々のサンプルのデータの違いをスピーディに俯瞰いただけます。

スタンダードプランはベーシックプランの解析内容に加え、サンプル群間の比較解析や機能解析を実施するプランです。発現変動遺伝子（DEG）解析，GeneOntology解析， IPAを用いたパスウェイ解析の3点が基本となりますが、その他にもGSEA解析，スプライシング解析，上流因子解析，融合遺伝子解析，SNP解析，De novo RNA-seqなどの対応が可能です。

QIAGEN社が提供するIPA（Ingenuity® Pathway Analysis）を用います。当社はQIAGEN社との契約により、受託サービスが実施できる商用ライセンスを日本国内で唯一保有しております（2022年1月時点）。IPA解析データ（表データ）の納品に加えて、Read Only Licenseを付与致します。このライセンスを利用して、お客様ご自身がIPAを用いて解析結果が可視化されたデータをご覧いただけます。

可能です。別途見積いたしますので、お問い合わせください。

GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）とは、特定の機能に関連することが知られている遺伝子セットと、RNA-seqより得られた発現変動遺伝子との相関を算出し、その発現変動によりもたらされる生物学的意義を推定する解析手法です。

発現変動遺伝子や遺伝子群について、そのプロモーター領域に存在する転写因子結合モチーフを解析する手法です。パスウェイ解析を用いる場合と転写因子のモチーフを用いる場合がございますが、研究目的に応じて解析を実施します。

スプライシング解析とは、一つの遺伝子座より転写されるRNAにおいて、選択的スプライシングにより、異なるエクソン領域を包含するRNAを同定する解析手法です。

スプライシング解析には、一般的に1検体あたり4000万リード〜10000万リードが必要と言われています。当社では8000万リード以上のデータ量を推奨しています。

トランスクリプトSNP解析とは、シーケンスより得られたRNA配列を用いて、リファレンスと異なる一塩基多型（SNP）を検出する解析手法です。

当社では4000万リード以上のデータ量を推奨しています。

シーケンスより得られたRNA配列を用いて、染色体の転座、逆位等により生じる複数の遺伝子が連結した遺伝子を検出する解析手法です。

対象とする組織や発現量によって、一般的に1500〜7000万リードが必要と言われています。
当社では5000万リード以上のデータ量を推奨しています。

リファレンスゲノムが未知または不十分である生物種において、シークエンスにより得られたRNA配列をassembleし、検体で発現している転写産物の配列を構築する解析手法です。

生物種に依存しますが、当社では8000万リード以上のデータ量を推奨しています。

可能です。２群間総当たりで比較する場合と、全群で比較するパターンがございます。それぞれ料金が異なりますので、詳細はお問い合わせください。