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非モデル生物や作物近縁種の研究の幅を広げる

de novo
ゲノムアセンブルサービス

  • Hi-Cによるスキャフォールディングや下流解析など豊富なカスタムプラン
  • PacBio / Oxford Nanopore ロングリードアセンブル

研究現場の課題

研究対象が潜在的に有用な性質を持つものの、ゲノム情報が不十分で解析できない・・・

Feature

ゲノム配列情報は基礎研究から育種などの応用的な研究に至るまで非常に重要な情報基盤です。
近年、機器の進歩とシーケンス価格の低下により研究室レベルの予算でゲノム決定ができる時代となりました。

Rhelixaならできること

Plan

データ取得料金

PacBio Sequell II
CLRロングリードシーケンス
料金
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※シーケンス深度は50xカバレッジを目安としてご提案いたします。

料金例
イネ [Oryza sativa] 50xカバレッジ (20Gb)
ライブラリー調製 + シーケンス料金
= 290,000円 (税抜) / 1検体
PacBio Sequell II
CCS (Hifi Read) ロングリードシーケンス
料金
お問い合わせ

※1 SMRT Cell (280G bases) 単位でのご提案となります。相乗りシーケンスは承っておりません。

料金例
キイロショウジョウバエ [drosophila melanogaster] 280Gb
ライブラリー調製 + シーケンス料金
= 820,000円 (税抜) / 1検体
Oxford Nanopore Technology
ロングリードシーケンス
料金
お問い合わせ

※シーケンス深度は50xカバレッジを目安としてご提案いたします。

料金例
コウジカビ [Aspergillus oryzae] 50xカバレッジ (2Gb)
ライブラリー調製 + シーケンス料金
= 100,000円 (税抜) / 1検体
Illumina / MGI platform
ショートリードシーケンス
料金

料金は下記リンクよりご確認ください。

※RNA-seqデータを組み合わせることで、遺伝子予測精度の向上が期待できます。

WGSショートリードシーケンス RNA-seq(ショートリード)

データ解析料金

原核生物 真核生物ゲノムサイズ
~100Mb以下
真核生物ゲノムサイズ
101~500Mb
真核生物ゲノムサイズ
501~1000Mb
標準
ゲノムアセンブル
150,000
(税抜)/プロジェクト
250,000
(税抜)/プロジェクト
650,000
(税抜)/プロジェクト
1,000,000
(税抜)/プロジェクト
標準
in silico アノテーション
100,000
(税抜)/プロジェクト
200,000
(税抜)/プロジェクト
350,000
(税抜)/プロジェクト
500,000
(税抜)/プロジェクト
オプション
染色体スキャンフォールディングv
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オプション
下流解析
お問い合わせ
価格例イネ PacBio CLRシーケンス+アセンブルパック
データ取得 (ライブラリー調製+シーケンス)
1サンプル
= 290,000
データ解析
- ゲノムアセンブル
1プロジェクト
= 650,000
- in silico アノテーション
1プロジェクト
= 350,000
- [オプション] WGSショートリードシーケンス
1サンプル
= 55,000
合計
= 1,345,000 円(税抜)

平日12時までのお問い合わせは当日回答します

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03-6240-9330

Flow

Sample

アセンブルしたゲノムとDNAメチル化の表現

アセンブルしたゲノムとDNAメチル化の表現

染色体スキャフォールディング(Hi-C)

染色体スキャフォールディング(Hi-C)

生物間の比較ゲノム解析

生物間の比較ゲノム解析 ー新規にゲノムを構築することで大規模構造変異を同定

FAQ

ゲノムアセンブルの精度はどの程度か?

ゲノムサイズやヘテロ接合性に依存しますが、弊社の経験上、コンティグのN50が800kb-10Mb、BUCO値が95%以上のアセンブルを取得しています。

送付するサンプル要件は?

PacBio Platformはこちら、Nanopore Platformはこちらよりご確認ください。

WGSショートリードシーケンスはこちらの『サンプル受入要件』をご参照ください。

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